'"Deus não está jogando dados" Einstein

Autores :  Sodré GB Neto, Alex Santos
geologiaatual@gmail.com
cancerlinfocito@gmail.com

Resumo: Nelson Rodrigues, famoso escritor  brasileiro, disse que a "unanimidade é burra" e que quando todos pensam a mesma coisa, é porque ninguém está pensando" . Podemos confirmar estas simples e profundas declarações numa conversa com uma pessoa mais forte que seja ameaçadora, se estiver armada, for muito rica e/ou poderosa,   quase todos covardemente concordam. Confirmamos isso na mentalidade religiosa de lugares que sofrem ameaças como no Islamismo,  ou no catolicismo medieval sob os olhos da santa diabólica inquisição,  onde a unanimidade só foi rompida debaixo de muitas sangrentas guerras protestantes e algumas revoluções iluministas  exageradamente fatais.  No mundo acadêmico tem ocorrido em relação ao darwinismo evolucionista "moderno", a mesma coisa : _Todos falam em uníssono , até pra não ter suas aulas canceladas por um grupelho que controla a  universidade a seu modo, ou quando falam declaram nos corredores, as escondidas ou fazem como meu professor de astronomia, que  ao final da aula ia  falar que quem ou quê fez o universo "tinha o mapa", mas que se alguém perguntar se ele falou isso nunca iria admitir. Um absurdo em pleno século XXI.

Ciência não tem preconceitos , ou não deveria ter, o que deveria sempre "reger a ciência são apenas dados" repete um dos maiores cientistas da atualidade ,  brasileiro, Marcos Nogueira Eberlin.  Mas o que tem regido ciência muitas vezes não são os dados, mas  regras injustas preconceituosas epistemológicas como demonstra ser o a regra do "naturalismo metafísico" , pois ciência é muitas vezes  apenas crenças confirmadas, refinadas, aprimoradas, trabalhadas e/ou filtradas .

Diversas expressões refinadíssimas e altamente científicas ligadas ao "Design Inteligente", da taxonomia da descontinuidade sistemática de grupos das espécies originais (baramilogy), modelos geológicos neo catastrofistas criacionistas, questionamentos dos erros claros do sistema de datação radiométrica,  que acabam por confirmar crenças populares,  tem estabelecido seu espaço em publicações , em protestos com milhares de cientistas como a lista de "Dissident from Darwin" que congrega hoje milhares de celebridades do mundo científico, e diversas listas de publicações como na rússia  ou listas da discovery de publicações científicas em revistas indexadas que defendem op "Design Inteligente".  

Aqui no Brasil, diante de tanta exigência do mundo acadêmico seja pela internet ou por contatos presenciais, quando foi por volta de 2005 ,  fomos os primeiros a elaborar uma lista de artigos científicos defendendo DI e criacionismo, depois , em 2016, foi lançada a  lista do Everton Fernandes e percebendo que diversas publicações ainda estavam de fora, decidi pedir ajuda a alguns criacionistas  para publicarmos uma revisão bibliográfica a respeito, daí surgiu a lista do Alex Santos, e esperamos que mais listas distinguindo aspectos, possam surgir. Aqui reunimos uma ideia inicial de como podem ser organizadas . A todo momento teremos mais atualizações e mais artigos científicos .

Pretendemos reunir aqui várias listas com várias categorias:

I. Lista geral por ordem de publicação de artigos DI em revistas indexadas

II. Lista por áreas, subáreas

III. Listas de Artigos Simpáticos a temas Criacionistas e do DI com sintonia fina, cladística monofilética, entropia, pontualismo fóssil, críticas a métodos de datação, entropia genética como do Dr. John Sanford refutando a base genética do evolucionismo histórico  ou do Dr. Gerald Crabttree que defende que a humanidade está ficando cada vez mais retardada.

IV. Lista de artigos científicos anulados pela patrulha Darwinista e de ateus (aqui podemos enumerar alguns como um nosso  https://web.archive.org/web/20190119043352/https://academiapublishing.org/journals/ajsr/abstract/2017/Jul/Neto%20et%20al.htm )

V. Lista de artigos científicos publicados em revistas com revisão de pares (peer review) criacionistas, do DI, da baraminology

VI. Lista de temas científicos que indiretamente estão automaticamente defendendo aspectos do criacionismo do DI como artigos ligados a funcionalidade , engenharia, coeficiente de informação e premeditação, aspecto de probabilidade, entropia, entropia genética, etc. Neste caso sabemos que teríamos que colocar milhões de artigos, mas tentaremos selecionar mais citados, autores criacionistas ou do ID, índice scopus, etc.

VII. Lista dos mais citados e com maior poder de impacto

I. Lista geral por ordem de publicação de artigos DI em revistas indexadas com seus respectivos resumos

Artigos científicos organizados por ano de publicação em ordem crescente

Critérios para inclusão:

Artigos científicos revisado por pares publicados em revistas indexadas e de reconhecido valor e credibilidade acadêmica.

Critérios para exclusão:

Para estabelecer esta lista foram excluídos livros, artigos retratados pela editora e retraídos, artigos não revisados por pares, artigos publicitários de jornais, revistas e blogs. Foram retirados também artigos com temas semelhantes, e artigos de divulgação científica.

1° (1983) Scherer, Siegfried "Basic functional states in the evolution of light-driven cyclic electron transport." Journal of theoretical biology  https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/0022519383904162

2° (1984) Lambert GR. Enzymic editing mechanisms and the origin of biological information transfer. J Theor Biol  https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022519384800983

O conhecimento atual dos mecanismos de edição enzimática na replicação, transcrição e tradução de DNA pode ser usado para prever taxas de erro na ausência de edição. Enzimas primitivas que possuíam atividade sintética, mas ainda não possuem mecanismos de edição, teriam taxas de erro extremamente altas, resultando em proteínas heterogêneas. Com base no conhecimento atual de biologia molecular e bioquímica, conclui-se que a evolução dos sistemas contemporâneos de transferência de informações de sistemas primitivos sem esses mecanismos de edição continua sendo um problema não resolvido na biologia teórica.

3° (1984) William G. Pollard, “Rumors of transcendence in physics” American Journal of Physics https://ui.adsabs.harvard.edu/abs/1984AmJPh..52..877P/abstract 

Existem várias dicas na física de um domínio da realidade externa transcendente ao espaço e tempo tridimensionais. Este artigo chama atenção para várias dessas sugestões de um mundo real além da ordem natural. Exemplos são as funções complexas do estado no espaço de configuração da mecânica quântica, a singularidade no nascimento do universo, o princípio antrópico, o papel do acaso na evolução e a inexplicável fecundidade da matemática para a física. Nenhum desses exemplos toca na existência ou atividade de Deus, mas sugere que a realidade externa pode ser muito mais rica que o mundo natural, que é tarefa da física descrever.

4° (1984) Kenyon D. HA Comparison of Proteinoid and Aldocyanoin Microsystems as Models of the Primordial Protocell. In: Matsuno K., Dose K., Harada K., Rohlfing D.L. (eds) Molecular Evolution and Protobiology. Springer, Boston, https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-1-4684-4640-1_13

Talvez mais do que qualquer outro investigador, o professor Sidney Fox ajudou a construir o tipo de sólido fundamento empírico sobre o qual qualquer discussão significativa sobre a origem da vida deve se basear. Seu trabalho teve um impacto significativo em minha própria pesquisa sobre a origem da vida. A teoria do microssistema proteinóide é um dos modelos atuais mais importantes de protobiogênese e acompanho seu desenvolvimento ao longo dos anos com interesse e admiração. Especialmente impressionante é o escopo dessa visão, variando desde a síntese primordial de aminoácidos de gases simples até o início da síntese de polipeptídeos direcionados por ácidos nucleicos em unidades microscópicas de dimensões bacterianas (Fox, 1978; Fox e Dose, 1977). citado no "pós pós biologia", https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0016328717303282 que relaciona o projeto SETI  e suas ferramentas de busca de inteligencia extraterrestre.

5° (1984) Scherer, S. Transmembrane electron transport and the neutral theory of evolution. Origins Life Evol Biosphere
https://link.springer.com/article/10.1007/BF00933727

6° (1985)Scherer, S. Could life have arisen in the primitive atmosphere? https://link.springer.com/article/10.1007%2FBF02105809

Livro de alto impacto muito citado (1986)Berlinski D. The Language of Life. In: Casti J.L., Karlqvist A. (eds) Complexity, Language, and Life: Mathematical Approaches. Biomathematics, vol 16. Springer, Berlin, Heidelberg https://www.springer.com/gp/book/9783642709555

Em maio de 1984, o Conselho Sueco de Pesquisa Científica reuniu um pequeno grupo de pesquisadores na estação de pesquisa científica de Abisko, na Suécia, com o objetivo de examinar várias visões conceituais e matemáticas da evolução de sistemas complexos. O tema declarado da reunião foi deliberadamente mantido vago, com apenas o objetivo de discutir abordagens matematicamente alternativas à modelagem de processos em evolução, sendo fornecidas como orientação aos participantes. A fim de limitar o escopo em algum grau, foi decidido enfatizar os processos vivos e não vivos e convidar participantes de uma variedade de especialidades disciplinares que abrangem o espectro, da matemática pura e aplicada à geografia e filosofia analítica. Os resultados da reunião foram extraordinários; embora não houvesse intenção de concentrar os trabalhos e a discussão em canais predefinidos, ocorreu um efeito imediato de auto-organização e as deliberações rapidamente se orientaram em três fluxos principais: estruturas conceituais e formais para caracterizar a complexidade do sistema; processos evolutivos em biologia e ecologia; o surgimento da complexidade através da evolução em idiomas naturais. Os capítulos apresentados neste volume não são os procedimentos da reunião. Após a reunião, os organizadores acharam que as idéias e o espírito da reunião deveriam ser preservados de alguma forma escrita, para que os participantes fossem solicitados a produzir um capítulo, explicando as visões que apresentavam na Abisko, escritas especificamente para este volume. Os resultados deste exercício formam o volume que você segura na sua mão.

7° (1987) Stanley L. Jaki, “Teaching of Transcendence in Physics, ” American Journal of Physics https://aapt.scitation.org/doi/10.1119/1.14946

Esforços destinados a mostrar que a física moderna aponta para um fator verdadeiramente transcendental como explicação do universo devem ser bem-vindos por aqueles que instaram o ensino da física em um amplo contexto cultural. Esses esforços podem se beneficiar das seguintes diretrizes: evitar a base antitológica da interpretação de Copenhague sobremecânica quântica; fazer grande parte da realidade do universo e seu enorme grau de especificidade, revelado por relatividade geral e a radiação cósmica de fundo; explorar a incompletude de Gödel teoremas contra qualquer grande unificado teoriaproposto como se fosse verdade um p r i o r i e necessariamente; e percebe que o argumento do design sempre pressupõe a validade do argumento cosmológico.

8° (1988) Klaus Dose, “ The Origin of Life: More Questions Than Answers” Interdisciplinary Science Reviews https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1179/isr.1988.13.4.348

Mais de 30 anos de experimentação sobre a origem da vida nos campos da evolução química e molecular levaram a uma melhor percepção da imensidão do problema da origem da vida na Terra, e não à sua solução. Atualmente, todas as discussões sobre as principais teorias e experimentos no campo terminam em impasse ou em uma confissão de ignorância. Novas linhas de pensamento e experimentação devem ser tentadas. A exploração contínua de nosso sistema solar, especialmente um melhor conhecimento de Marte e Vênus, de cometas e meteoritos carbonáceos também pode levar a uma melhor compreensão do ambiente prebiótico na Terra e, assim, nos ajudará a projetar experimentos de simulação prebiótica mais apropriados.

9° (1997) Wolf-Ekkehard Lönnig, Saedler H “Plant transposons: contributors to evolution? ” Gene  https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0378111997003971

Um espectro de diferentes hipóteses foi apresentado por vários autores, desde elementos transponíveis de plantas como principais agentes na evolução até exatamente o oposto, transposons como DNA principalmente egoísta, constituindo uma carga genética para os organismos. A análise a seguir se concentrará em: (1) uma breve pesquisa das duas principais avaliações diferentes dos elementos transponíveis (ETs) sobre a origem das espécies (DNA egoísta versus útil); (2) o significado da hierarquia de funções e redundâncias de genes para atividades de ET (egoísta em partes não redundantes do genoma, mas como fonte de variabilidade no restante); (3) a relevância dos resultados da pesquisa da TE em Zea mays e Antirrhinum majuspara formação de espécies na natureza (contraste entre seleção artificial e natural); (4) três áreas de pesquisa em que parece possível uma síntese entre as duas diferentes avaliações de ETE: evolução regressiva, origem dos ecótipos e origem das plantas cultivadas; e (5) algumas perspectivas possíveis sobre a formação de espécies induzidas por TE nas angiospermas em geral, ou seja, a diferença básica entre os conceitos sistemáticos e genéticos das espécies e a origem concebível de grande parte das morfoespécies de angiospermas devido à perda de função e outras mutações por Atividades de TE.

10° (1999) Solomon Victor, Vljaya M. Nayek, and Raveen Rajasingh, “Evolution of the Ventricles, ” Texas Heart Institute Journal

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC337097/

Estudamos a evolução dos ventrículos pelo exame macroscópico dos corações dos peixes marinhos cartilaginosos e ósseos, pela angiocardiografia e pelo exame macroscópico dos corações dos peixes de água doce, sapos, tartarugas, cobras e crocodilos que respiram ar. Um lúmen ventricular do lado direito e paredes finas é visto no peixe, sapo, tartaruga e cobra. Nos peixes, há simetria externa do ventrículo, assimetria interna e ventrículo esquerdo de paredes espessas com uma pequena câmara de entrada. Em animais como sapos, tartarugas e cobras, o ventrículo esquerdo existe como uma esponja contrátil de cavidades pequenas. A alta pressão gerada por esse ventrículo esquerdo esponjoso, a direção do jato, a orientação do ventrículo-arterial e a válvula espiral bulbar no sapo ajudam a separar as circulações sistêmica e pulmonar. No crocodilo, a aorta direita está conectada ao ventrículo esquerdo e há um septo interventricular completo e um lúmen do ventrículo esquerdo melhorado quando comparado com tartarugas e cobras. O coração está alojado em uma cavidade pericárdica rígida no tubarão, possivelmente para protegê-lo da alteração da pressão subaquática. A cavidade pericárdica em várias espécies permite movimentos do coração - que variam dependendo da orientação ventrículo arterial e da necessidade do ventrículo gerar torque ou rotação no sangue ejetado - que favorecem o escoamento para as artérias apropriadas e seus ramos. Nas espécies mais baixas, não está claro se o miocárdio esponjoso contribui para a oxigenação miocárdica. Nos seres humanos, o miocárdio esponjoso constitui uma forma rara de doença cardíaca congênita

11° (2000) Axe, Douglas D. "Extreme functional sensitivity to conservative amino acid changes on enzyme exteriors." Journal of Molecular Biology 301.3 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022283600939974

Estudos de mutagênese e alinhamentos de sequências homólogas demonstraram que a função da proteína é tipicamente compatível com uma variedade de resíduos de aminoácidos na maioria das posições externas do local não ativo. Essas observações levaram à visão atual de que as restrições funcionais na sequência são mínimas nessas posições. Aqui, é mostrado que essa inferência assume que o conjunto de resíduos aceitáveis ​​em cada posição é independente do contexto geral da sequência. Duas abordagens são usadas para testar essa suposição. Primeiro, substituições altamente conservadoras de resíduos externos, nenhuma das quais causaria perturbações funcionais significativas por si só, são combinadas até que aproximadamente uma em cada cinco tenha sido alterada. Verificou-se que isso causa perda completa da função in vivo para duas enzimas monoméricas não relacionadas:barnase (uma RNase bacteriana) e TEM-1 β-lactamase . Em segundo lugar, um conjunto de sequências híbridas é construído a partir de 50% TEM-1 e β-lactamases de Proteus mirabilis . Esses híbridos correspondem à sequência TEM-1, exceto por uma região no terminal Cfinal, onde são compostos aleatórios dos dois pais. Todos esses híbridos são biologicamente inativos. Em ambos os experimentos, a perda completa de atividade demonstra a importância do contexto de sequência na determinação de se as substituições são funcionalmente aceitáveis. Contrariamente à visão predominante, a função enzimática impõe severas restrições às identidades de resíduos em posições que mostram variabilidade evolutiva e em posições externas não ativas, em particular. Os homólogos que compartilham menos de cerca de dois terços da identidade de sequência provavelmente devem ser vistos como projetos distintos com seus próprios conjuntos de recursos de otimização.

Muito citado https://scholar.google.com/scholar?um=1&ie=UTF-8&lr&cites=6110524010010979042

12° (2002) Wolf-Ekkehard Lönnig & Saedler H. “Chromosome Rearrangement and Transposable Elements, ” Annual Review of Genetics https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12429698/

Até o momento, a visão de McClintock de regulação de genes por elementos transponíveis (TEs) tem sido limitada, embora sua proposta sobre a origem das espécies pelas reorganizações cromossômicas complexas induzidas por TE em combinação com mutações genéticas, ou seja, o envolvimento de ambos os fatores em formações repentinas de espécies em muitos gêneros de plantas e animais, tem sido mais promissor. Além disso, a resolução está à vista de vários fenômenos aparentemente contraditórios, como o rearranjo interminável de estruturas cromossômicas e seqüências de genes versus sintenidade e a constância de fósseis vivos (ou estase em geral). Investigações abrangentes recentes confirmaram e aumentaram o número de casos anteriores de seleção de locais de destino da TE (pontos de acesso para a integração da TE), implicando rearranjos cromossômicos pré-estabelecidos e não acidentais para recombinação não-homóloga do DNA do hospedeiro. A possibilidade de uma geração parcialmente predeterminada de biodiversidade e novas espécies é discutida. As opiniões de vários especialistas em transposões sobre a origem abrupta de novas espécies não foram sintetizadas na teoria macroevolucionária da escola de paleontologia pontuada de equilíbrio inferida a partir de características completamente consistentes do registro fóssil.

Citado 167 vezes https://scholar.google.com/scholar?um=1&ie=UTF-8&lr&cites=6233926009302601907

13° (2002) M.J. Denton, J.C. Marshall & M. Legge, “The Protein Folds as Platonic Forms: New Support for the pre-Darwinian Conception of Evolution by Natural Law, ” Journal of Theoretical Biology https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12419661/

Antes da revolução darwiniana, muitos biólogos consideravam as formas orgânicas determinadas pela lei natural como átomos ou cristais e, portanto, características intrínsecas e imutáveis ​​da ordem mundial, que ocorrerão em todo o cosmos onde quer que haja vida. A busca pelos determinantes naturais da forma orgânica - as célebres "Leis da Forma" - foi vista como uma das principais tarefas da biologia. Depois de Darwin, essa concepção platônica de forma foi abandonada e a seleção natural, e não a lei natural, foi cada vez mais vista como o principal, senão o exclusivo, determinante da forma orgânica. No entanto, no caso de uma classe de formas orgânicas muito importantes - as dobras de proteínas básicas - os avanços na química de proteínas desde o início dos anos 70 revelaram que eles representam um conjunto finito de formas naturais, determinado por um número de regras construtivas generativas, como as que governam a formação de átomos ou cristais, nas quais as adaptações funcionais são claramente modificações secundárias dos "dados da física" primários. As dobras são evidentemente determinadas pela lei natural, não pela seleção natural, e são "formas lícitas" no sentido platônico e pré-darwiniano da palavra, que provavelmente ocorrerão em todo o universo onde os mesmos 20 aminoácidos são usados ​​para a sua reprodução. construção. Argumentamos que esta é uma descoberta importante que tem muitas implicações importantes sobre a origem das proteínas, a origem da vida e a natureza fundamental da forma orgânica. Especulamos que é improvável que as dobras se mostrem o único caso na natureza em que um conjunto de formas orgânicas complexas é determinado pela lei natural,

14° (2003) Frank J. Tipler, “Intelligent Life in Cosmology, ” International Journal of Astrobiology https://arxiv.org/abs/0704.0058#:~:text=requires%20intelligent%20life%20to%20survive,times%20in%20the%20visible%20universe.

Apresentarei três argumentos para a proposição de que a vida inteligente é muito rara no universo. Primeiro, resumirei a opinião de consenso dos fundadores da Síntese Moderna (Simpson, Dobzhanski e Mayr) de que a evolução da vida inteligente é extremamente improvável. Segundo, desenvolverei o Paradoxo de Fermi: se existissem, estariam aqui. Terceiro, mostrarei que, se a vida inteligente fosse muito comum, ela consumiria todos os recursos disponíveis e desapareceria. Mas mostrarei que o princípio da unitariedade da mecânica quântica (na verdade uma forma de teleologia!) Exige que a vida inteligente sobreviva até o fim dos tempos. Finalmente, argumentarei que, se o universo está realmente acelerando, a sobrevivência até o fim dos tempos exige que a vida inteligente, embora rara, tenha evoluído várias vezes no universo visível. Argumentarei que a aceleração é uma conseqüência do excesso de matéria sobre a antimatéria no universo. Vou sugerir experimentos para testar essas alegações.

15° (2004) Trevors, Jack T., and David L. Abel. "Chance and necessity do not explain the origin of life." Cell Biology International
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1065699504001416

Onde e como surgiu o complexo conjunto de instruções genéticas programadas no DNA? O conjunto genético pode ter surgido em outro lugar e foi transportado para a Terra. Caso contrário, ele surgiu na Terra e se tornou o código genético em um mundo físico-químico anterior, sem vida. Mesmo se o RNA ou o DNA fossem inseridos em um mundo sem vida, eles não conteriam instruções genéticas, a menos que cada seleção de nucleotídeos na sequência fosse programada para funcionar. Mesmo assim, um sistema de comunicação predeterminado teria que estar em vigor para que qualquer mensagem fosse entendida no destino. Transcrição e tradução não seriam necessariamente necessárias em um mundo de RNA. Ribozimaspoderia ter realizado algumas das funções mais simples das enzimas proteicas atuais. A modelagem de cadeias de RNA únicas seguidas pela rememplação de volta para uma cadeia de sentido poderia ter ocorrido. Mas esse processo não explica a derivação do "sentido" em nenhum elemento. “Sentido” significa função algorítmica alcançada através de sequências de certas configurações de comutador de nó de decisão. Essas estruturas primárias particulares determinam estruturas secundárias e terciárias . Cada sequência determina propensões mínimas de dobra de energia livre, especificidade do local de ligação e função. Seria necessário um metabolismo mínimo para que as células fossem capazes de crescer e se dividir. Todo o metabolismo conhecido é cibernético - ou seja, é organizado e controlado de forma programática e algorítmica.

16° (2004) Michael Behe & David W. Snoke, “Simulating evolution by gene duplication of protein features that require multiple amino acid residues, ” Protein Science https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2286568/

Pensa-se que a duplicação de genes é uma das principais fontes de inovação evolutiva, pois permite que uma cópia de um gene mude e explore o espaço genético enquanto a outra cópia continua a cumprir a função original. Modelos do processo geralmente assumem implicitamente que uma única mutação no gene duplicado pode conferir uma nova propriedade selecionável. No entanto, algumas características proteicas, como ligações dissulfeto ou locais de ligação a ligantes, requerem a participação de dois ou mais resíduos de aminoácidos, o que pode exigir várias mutações. Aqui modelamos a evolução de tais características proteicas pelo que consideramos ser a mutação conceitual mais simples de rota - ponto em genes duplicados. Mostramos que para tamanhos populacionais muito grandes N, onde no estado estacionário, na ausência de seleção, a população deve conter um ou mais alelos duplicados que codificam para o recurso, o tempo de fixação na população fica próximo ao inverso da taxa de mutação pontual e varia lentamente com o λ ^th raiz de 1 / N , onde λ é o número de posições de nucleótidos que devem ser mutadas para produzir a característica. Em tamanhos populacionais menores, o tempo para fixação varia linearmente com 1 / N e excede o inverso da taxa de mutação pontual. Concluímos que, em geral, deve ser fixado em 10 ⁸gerações, a produção de novas características proteicas que requerem a participação de dois ou mais resíduos de aminoácidos simplesmente por mutações pontuais múltiplas em genes duplicados implicaria tamanhos populacionais não inferiores a 10 ⁹ .

17° (2004) Douglas D. Axe, “Estimating the Prevalence of Protein Sequences Adopting Functional Enzyme Folds, ” Journal of Molecular Biology https://doi.org/10.1016/j.jmb.2004.06.058

As proteínas empregam uma grande variedade de dobras para desempenhar suas funções biológicas. Como essas dobras são adquiridas pela primeira vez? Um passo importante para responder a isso é obter uma estimativa da prevalência geral de sequências que adotam dobras funcionais. Como a estrutura terciária é necessária para a formação de um local ativo típico da enzima , uma maneira de obter essa estimativa é medir a prevalência de sequências que suportam um local ativo em funcionamento. Embora o imenso número de combinações de sequências inviabilize a amostragem totalmente aleatória, duas simplificações importantes podem fornecer uma solução. Primeiro, dada a importância das interações hidrofóbicas para o dobramento de proteínas, parece provável que o espaço da amostra possa ser restrito a sequências com a assinatura hidropática de uma dobra conhecida. Segundo, como as dobras são estabilizadas pela ação cooperativa de muitas interações locais distribuídas por toda a estrutura, o problema geral da estabilização de dobras pode ser visto razoavelmente como uma coleção de problemas locais acoplados. Isso permite avaliar a dificuldade de todo o problema, avaliando a dificuldade de vários problemas menores. Usando essas simplificações, a dificuldade de especificar uma β-lactamase ativadomínio é avaliado aqui. Um alinhamento de sequências de domínios homólogos é usado para deduzir o padrão de restrições hidropáticas ao longo de cadeias que formam a dobra de domínio. Começando com uma sequência fracamente funcional carregando essa assinatura, grupos de dez cadeias laterais dentro da dobra são substituídos aleatoriamente, dentro dos limites da assinatura e testados quanto à função. A prevalência da função de baixo nível em quatro de tais experiências indicam que cerca de uma em 10 ^{de 64} sequências de formas de assinatura consistente um domínio de trabalho. Combinado com a prevalência estimada de padrões hidropáticos plausíveis (para qualquer dobra) e de dobras relevantes para funções específicas, isso implica que a prevalência geral de sequências executando uma função específica por qualquer dobra de tamanho de domínio pode ser tão baixa quanto 1 em 10 ⁷⁷, acrescentando ao corpo de evidências que as dobras funcionais exigem sequências altamente extraordinárias.

18° (2004) S. A. Minnich & S. C. Meyer “Genetic analysis of coordinate flagellar and type III regulatory circuits in pathogenic bactéria” Proceedings of the Second International Conference on Design & Nature, Rhodes Greece  https://www.witpress.com/elibrary/wit-transactions-on-ecology-and-the-environment/73/12393

O flagelo bacteriano representa uma das máquinas moleculares mais bem compreendidas. Composto por 40 peças que se auto-montam em um verdadeiro motor rotativo, a bioquímica e a genética desses sistemas revelaram uma complexidade imprevista. Um componente essencial para a montagem é o subconjunto de peças que funcionam como uma bomba secretora de proteínas para garantir e discriminar que o número correto de subunidades de proteínas e sua ordem de secreção sejam regulados com precisão durante a montagem. De interesse adicional é o reconhecimento tardio de que vários patógenos importantes de plantas e animais usam uma bomba secretora de proteínas relacionada, fundida a uma seringa em forma de agulha que mede a membrana, através da qual um subconjunto de toxinas pode ser injetado

19° (2005) Heinz-Albert Becker and Wolf-Ekkehard Lönnig, “Transposons: Eukaryotic, ” Encyclopedia of Life Sciences https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/9780470015902.a0026265 

https://www.researchgate.net/publication/228034907_Transposons_Eukaryotic

https://www.mpipz.mpg.de/53880/Scientific_Overview_2003.pdf 

20° (2005) John A. Davison, “A Prescribed Evolutionary Hypothesis, ” Rivista di Biologia/Biology Forum
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15889345/

Proponho que a filogenia tenha ocorrido de maneira semelhante à da ontogenia pela desrepressão de informações genômicas pré-formadas, que foi expressa através da liberação da latência (desrepressão) pela reestruturação das informações cromossômicas existentes (efeitos de posição). Evidências indiretas e diretas são apresentadas em apoio à hipótese evolutiva prescrita.

21° (2005) David L. Abel and Jack T. Trevors, “Three subsets of sequence complexity and their relevance to biopolymeric information, ” Theoretical Biology and Medical Modeling https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1208958/

Os algoritmos genéticos instruem uma organização biológica sofisticada. Existem três tipos qualitativos de complexidade de sequência: aleatória (RSC), ordenada (OSC) e funcional (FSC). Somente o FSC fornece instruções algorítmicas. As complexidades de sequência aleatória e ordenada estão em extremidades opostas do mesmo vetor de complexidade de seqüência bidirecional. A aleatoriedade no espaço de sequência é definida pela falta de compressibilidade algorítmica de Kolmogorov. Uma sequência é compressível porque contém ordem e padrões redundantes. O determinismo de causa e efeito semelhante à lei produz ordem altamente compressível. Essa ordenação forçada impede a retenção de informações e a liberdade de seleção, tão críticas à programação e controle algorítmicos. A complexidade da sequência funcional requer essa dimensão de programação adicional da seleção não coagida em nós de decisão sucessivos na cadeia. A teoria da informação de Shannon mede os graus relativos de RSC e OSC. A teoria da informação de Shannon não pode medir o FSC. O FSC está invariavelmente associado a todas as formas de biofunção complexa, incluindo vias bioquímicas, ciclos, regulação de feedback positivo e negativo e metabolismo homeostático. A programação algorítmica do FSC, não apenas sua aperiodicidade, é responsável pela organização biológica. Não existe evidência empírica de que o RSC da OSC tenha produzido uma única instância de organização biológica sofisticada. A organização invariavelmente manifesta o FSC em vez de eventos aleatórios sucessivos (RSC) ou fenômenos de auto-ordenação com baixa informação (OSC)

22° (2005) Kirk Durston and David K. Y. Chiu, “A Functional Entropy Model for Biological Sequences, ” Dynamics of Continuous, Discrete & Impulsive Systems: Series B Supplement https://p2c.com/sites/default/files/documents/resource_file/Durston%26Chiu%20paper.pdf

23° (2005) Jonathan Wells, “Do Centrioles Generate a Polar Ejection Force? ” Rivista di Biologia / Biology Forum
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15889341/

Uma força de ejeção polar dependente de microtúbulos que empurra os cromossomos para longe dos pólos dos fusos durante a prometáfase é observada nas células animais, mas não nas células das plantas superiores. Microtúbulos alongados e moléculas motoras do tipo cinesina foram propostos como possíveis causas, mas nenhum deles é responsável por todos os dados. Na hipótese proposta aqui, uma força de ejeção polar é gerada por centríolos, encontrados em animais, mas não em plantas superiores. Centríolos consistem em nove trigêmeos de microtúbulos dispostos como as pás de uma pequena turbina. Em vez de ver os centríolos através dos espetáculos do reducionismo molecular e do neodarwinismo, essa hipótese pressupõe que eles sejam holisticamente projetados para serem turbinas. Turbinas centriolares orientadas ortogonalmente podem gerar oscilações nos microtúbulos do fuso que se assemelham ao movimento produzido por um vortexer de laboratório. O resultado seria uma força de ejeção mediada por microtúbulos, tendendo a mover os cromossomos para longe do eixo do fuso e dos pólos. Um aumento no cálcio intracelular no início da anáfase pode regular a força de ejeção polar desligando as turbinas centriolares, mas a regulação defeituosa pode resultar em uma força excessiva que contribui para a instabilidade cromossômica característica da maioria das células cancerígenas.

24° (2006) Øyvind Albert Voie “Biological function and the genetic code are interdependent” Chaos, Solitons and Fractals
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960077905008052

A vida nunca deixa de surpreender os cientistas, pois seus segredos são cada vez mais revelados. Em particular, a origem da vida permanece um mistério. Alguém se pergunta como a comunidade científica poderia desvendar um evento passado no passado com uma probabilidade tão baixa. Este artigo mostra que existem razões lógicas para esse problema. A vida expressa sistemas funcionais e de signos. Isso é paralelo à estrutura auto-referente simbólica logicamente necessária nos sistemas de auto-reprodução. Devido ao domínio abstrato dos sistemas de funções e signos, a vida não é um subsistema de leis naturais. Isso sugere que nossa razão é limitada em relação à solução do problema da origem da vida e que nos resta tomar a vida como axioma.

25° (2006) David L. Abel and Jack T. Trevors, “More than Metaphor: Genomes Are Objective Sign Systems, ” Journal of BioSemiotics

https://www.semanticscholar.org/paper/MORE-THAN-METAPHOR%3A-GENOMES-ARE-OBJECTIVE-SIGN-Abel-Trevors/268e482917b6cbd26764835c5e6d411aec30b17d?citationIntent=background#citing-papers
26° (2006) David L. Abel and Jack T. Trevors, “Self-organization vs. self-ordering events in lifeorigin models, ” Physics of Life Reviews

27° (2006) de Brito F.H., Teixeira A.N., Teixeira O.N., de Oliveira R.C.L. A Fuzzy Intelligent Controller for Genetic Algorithms’ Parameters. In: Jiao L., Wang L., Gao X., Liu J., Wu F. (eds) Advances in Natural Computation. ICNC 2006. Lecture Notes in Computer Science, vol 4221. Springer, Berlin, Heidelberg https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1571064506000224

O fenômeno da auto-ordenação não deve ser confundido com a auto-organização. Os eventos de auto-ordenação ocorrem espontaneamente de acordo com as propensões naturais da "lei" e são puramente físico-dinâmicos. A cristalização e as estruturas dissipativas espontaneamente formadas de Prigogine são exemplos de auto-ordenação. Os fenômenos de auto-ordenação não envolvem nós de decisão, interruptores configuráveis ​​dinamicamente inertes, portais lógicos, direção para o sucesso algorítmico ou "parada computacional". Hiper-motocicletas, algoritmos genéticos e evolutivos , redes neurais e autômatos celularesnão foi demonstrado que se auto-organiza espontaneamente em funções não triviais. Leis e fractais são algoritmos de compressão que contêm informações e complexidade mínimas. A organização geralmente contém grandes quantidades de informações prescritivas. As informações prescritivas instruem ou produz diretamente uma função algorítmica otimizada não trivial em seu destino. A prescrição requer contingência de escolha em vez de contingência ou necessidade casual. A organização requer prescrição e é abstrata, conceitual, formal e algorítmica. A organização utiliza um sistema de sinal / símbolo / token para representar muitas configurações configuráveis ​​do comutador. As configurações de chave física permitem a instanciação de seleções não-físicas para função na fisicalidade. As configurações do comutador representam opções em nós de decisão sucessivos que integram circuitos e instanciam o gerenciamento cooperativo em sistemas físicos conceituais. As posições dos comutadores devem ser livremente selecionáveis ​​para funcionar como portas lógicas. Os interruptores devem ser definidos de acordo com regras, não leis. A inanimacia não pode se "organizar". A inanimação só pode se auto-ordenar. A “auto-organização” não tem suporte empírico e que preenche as previsões. Não existe uma teoria falsificável da auto-organização. A “auto-organização” não fornece mecanismo e não oferece poder explicativo verificável detalhado. Deve-se tomar cuidado para não usar erroneamente o termo “auto-organização” para se referir a eventos de baixa informação, processo natural e auto-ordenação, especialmente ao discutir informações genéticas. As posições dos comutadores devem ser livremente selecionáveis ​​para funcionar como portas lógicas. Os interruptores devem ser definidos de acordo com regras, não leis. A inanimacia não pode se "organizar". A inanimação só pode se auto-ordenar. A “auto-organização” não tem suporte empírico e que preenche as previsões. Não existe uma teoria falsificável da auto-organização. A “auto-organização” não fornece mecanismo e não oferece poder explicativo verificável detalhado. Deve-se tomar cuidado para não usar erroneamente o termo “auto-organização” para se referir a eventos de baixa informação, processo natural e auto-ordenação, especialmente ao discutir informações genéticas. As posições dos comutadores devem ser livremente selecionáveis ​​para funcionar como portas lógicas. Os interruptores devem ser definidos de acordo com regras, não leis. A inanimacia não pode se "organizar". A inanimação só pode se auto-ordenar. A “auto-organização” não tem suporte empírico e que preenche as previsões. Não existe uma teoria falsificável da auto-organização. A “auto-organização” não fornece mecanismo e não oferece poder explicativo verificável detalhado. Deve-se tomar cuidado para não usar erroneamente o termo “auto-organização” para se referir a eventos de baixa informação, processo natural e auto-ordenação, especialmente ao discutir informações genéticas. Não existe uma teoria falsificável da auto-organização. A “auto-organização” não fornece mecanismo e não oferece poder explicativo verificável detalhado. Deve-se tomar cuidado para não usar erroneamente o termo “auto-organização” para se referir a eventos de baixa informação, processo natural e auto-ordenação, especialmente ao discutir informações genéticas. Não existe uma teoria falsificável da auto-organização. A “auto-organização” não fornece mecanismo e não oferece poder explicativo verificável detalhado. Deve-se tomar cuidado para não usar erroneamente o termo “auto-organização” para se referir a eventos de baixa informação, processo natural e auto-ordenação, especialmente ao discutir informações genéticas.

28° (2006) Edelmann, J.B., Denton, M.J. The uniqueness of biological self-organization: challenging the Darwinian paradigm. Biol Philos https://link.springer.com/article/10.1007/s10539-006-9055-5

Aqui discutimos o desafio colocado pela auto-organização à concepção darwiniana de evolução. Como ressaltamos, a seleção natural pode ser apenas o principal criativoagência na evolução se toda ou a maior parte da complexidade adaptativa manifestada nos organismos vivos for construída ao longo de muitas gerações pela seleção cumulativa de pequenas mutações ou variantes aleatórias que ocorrem naturalmente, isto é, etapas adicionais e incrementais por um período prolongado de tempo. A auto-organização biológica - testemunhada classicamente no dobramento de uma proteína ou na formação da membrana celular - é um meio fundamentalmente diferente de gerar complexidade. Concordamos que os sistemas de auto-organização podem ser aperfeiçoados pela seleção e que, portanto, a auto-organização pode ser considerada um mecanismo complementar à seleção natural como uma agência causal na evolução da vida. Mas argumentamos que, se a auto-organização provar ser um mecanismo comum para a geração de ordem adaptativa do nível molecular ao nível organísmico,agência criativa em evolução. Também destacamos que, embora sistemas complexos de auto-organização sejam fáceis de criar no domínio eletrônico dos autômatos celulares, até o momento não foi fácil traduzir em simulações silico em estruturas materiais reais que se auto-organizam em formas complexas a partir de interações locais entre seus constituintes. . Isso sugere que sistemas auto-organizados análogos aos utilizados por sistemas biológicos são pelo menos raros e podem de fato representar, como acreditavam os pré-darwinistas, uma hierarquia ascendente única de formas naturais. Essa hierarquia adaptativa única representaria outro grande desafio para a atual visão darwiniana da evolução, pois significaria que as formas básicas de vida são necessárias características da ordem da natureza e que os principais caminhos da evolução são determinados pela lei física, ou mais especificamente pelas propriedades auto-organizadas da biomatéria, em vez da seleção natural.

29° (2007) Lönnig W-E, Stüber K, Saedler H. and J H Kim Biodiversity and Dollo’s law: to what extent can the phenotypic differences between Antirrhinum majus and Misopates orontium be bridged by mutagenesis? Bioremediation, Biodiversity and Bioavailability https://pure.mpg.de/rest/items/item_1221704_1/component/file_1221703/content

30° (2007) David L. Abel, “Complexity, self-organization, and emergence at the edge of chaos in life-origin models, ” Journal of the Washington Academy of Sciences

31° (2007) Kirk K. Durston, David K. Y. Chiu, David L. Abel, Jack T. Trevors, “Measuring the functional sequence complexity of proteins, ” Theoretical Biology and Medical Modelling

32° (2007) Michael Sherman, “Universal Genome in the Origin of Metazoa: Thoughts About Evolution, ” Cell Cycle

33° (2007) Leisola, M., Turunen, O. Protein engineering: opportunities and challenges. Appl Microbiol Biotechnol

34° (2008) Douglas D. Axe, Brendan W. Dixon, Philip Lu, “Stylus: A System for Evolutionary Experimentation Based on a Protein/Proteome Model with Non-Arbitrary Functional Constraints ” PLoS One

35° (2008) David L. Abel, “The ‘Cybernetic Cut’: Progressing from Description to Prescription in Systems Theory, ” The Open Cybernetics and Systemics Journal

36° (2008) Richard v. Sternberg, “DNA Codes and Information: Formal Structures and Relational Causes, ” Acta Biotheoretica

37°Winston Ewert, William A. Dembski, and Robert J. Marks II, “Evolutionary Synthesis of Nand Logic: Dissecting a Digital Organism, ” Proceedings of the 2009 IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, pp. 3047-3053 (October, 2009)

38° Richard A. Carhart and Adam Cenian, “Implication of Proven Limits on Scientific Knowledge: Gödel’s Proof, Quantum Uncertainty, Chaos Theory and Specified Complexity of Information Theory, ” Bulletin de la Société Des Sciences Et Des Lettres de Łódź, Vol. LIX (Série: Recherches Sur Les Déformations LVIII): 7-18 (2009).

39° Winston Ewert, William A. Dembski, and Robert J. Marks II, “Evolutionary Synthesis of Nand Logic: Dissecting a Digital Organism,” Proceedings of the 2009 IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, pp. 3047-3053 (October, 2009)

40° William A. Dembski and Robert J. Marks II, “Bernoulli’s Principle of Insufficient Reason and Conservation of Information in Computer Search,” Proceedings of the 2009 IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics, pp. 2647 – 2652 (October, 2009).

41°William A. Dembski and Robert J. Marks II, “Conservation of Information in Search: Measuring the Cost of Success,” IEEE Transactions on Systems, Man, and CyberneticsPart A: Systems and Humans, Vol. 39(5):1051-1061 (September, 2009)

42°David L. Abel, “The Universal Plausibility Metric (UPM) & Principle (UPP),” Theoretical Biology and Medical Modelling, Vol. 6(27) (2009).

43°David L. Abel, “The Capabilities of Chaos and Complexity,” International Journal of Molecular Sciences, Vol. 10:247-291 (2009).

44°David L. Abel, “The biosemiosis of prescriptive information, ” Semiotica, Vol. 174(1/4):1-19 (2009)

45°D. Halsmer, J. Asper, N. Roman, and T. Todd, “The Coherence of an Engineered World, ” International Journal of Design & Nature and Ecodynamics, Vol. 4(1):47–65 (2009)

46°AC. McIntosh, “Information and Entropy—Top-Down or Bottom-Up Development in Living Systems, ” International Journal of Design & Nature and Ecodynamics,

47°A.C. McIntosh, “Evidence of design in bird feathers and avian respiration,” International Journal of Design & Nature and Ecodynamics, Vol. 4(2):154–169 (2009)

48°Winston Ewert, William A. Dembski, Robert J. Marks II, “Measuring meaningful information in images: algorithmic specified complexity,” IET Computer Vision

49°Joseph Esfandiar Hannon Bozorgmehr Is gene duplication a viable explanation for the origination of biological information and complexity? Complexity (2010)

50° William A. Dembski and Robert J. Marks II, “The Search for a Search: Measuring the Information Cost of Higher Level Search, ” Journal of Advanced Computational Intelligence and Intelligent Informatics, Vol. 14 (5):475-486 (2010)

51°Winston Ewert, George Montañez, William Dembski and Robert J. Marks II, “Efficient Per Query Information Extraction from a Hamming Oracle, ” 42nd South Eastern Symposium on System Theory, pp. 290-297 (March, 2010)

52°David L. Abel, “Constraints vs Controls, ” The Open Cybernetics and Systemics Journal, Vol. 4:14-27 (January 20, 2010)

53°David L. Abel, “The GS (genetic selection) Principle, ” Frontiers in Bioscience, Vol. 14:2959-2969 (January 1, 2010)

54°Michael J. Behe, “Experimental Evolution, Loss-of-Function Mutations, and ‘The First Rule of Adaptive Evolution, ’” The Quarterly Review of Biology, Vol. 85(4):1-27 (December 2010)

55°Kirk K. Durston, David K.Y. Chiu, Andrew K.C. Wong, and Gary C.L. Li, “Statistical discovery of site inter-dependencies in sub-molecular hierarchical protein structuring,” EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (2012)

56°Joseph A. Kuhn, “Dissecting Darwinism,” Baylor University Medical Center Proceedings, Vol. 25(1): 41-47 (2012)

57° David L. Abel, “Is Life Unique? ” Life, Vol. 2:106-134 (2012)

58°D'Onofrio, D.J., Abel, D.L. & Johnson, D.E. Dichotomy in the definition of prescriptive information suggests both prescribed data and prescribed algorithms: biosemiotics applications in genomic systems. Theor Biol Med Model

59°Vladimir I. shCherbak and Maxim A. Makukov, “The ‘Wow! Signal’ of the terrestrial genetic code, ” Icarus, Vol. 224 (1): 228-242 (May, 2013)

60° Winston Ewert, William A. Dembski and Robert J. Marks II, “Conservation of Information in Relative Search Performance, ” Proceedings of the 2013 IEEE 45th Southeastern Symposium on Systems Theory (SSST), Baylor University, March 11, 2013

61° Winston Ewert, William A. Dembski and Robert J. Marks II, "On the Improbability of Algorithmically Specified Complexity,'' Proceedings of the 2013 IEEE 45th Southeastern Symposium on Systems Theory (SSST), Baylor University, March 11, 2013

62° Steinar Thorvaldsen and Peter Øhrstrøm, “Darwin’s Perplexing Paradox intelligent design in nature, ” Perspectives in Biology and Medicine, Vol. 56 (1): 78-98 (Winter, 2013)

63° Berkley E. Gryder, Chase W. Nelson, and Samuel S. Shepard, “Biosemiotic Entropy of the Genome: Mutations and Epigenetic Imbalances Resulting in Cancer, ” Entropy, 15: 234-261 (2013)

64° Marks II, Robert J., et al., eds. Biological information: New perspectives. World Scientific Publishing Company, 2013.

65° John Sanford, Wesley Brewer, Franzine Smith, and John Baumgardner, “The waiting time problem in a model hominin population, ” Theoretical Biology and Medical Modelling, Vol. 12:18 (2015)

66° David W. Snoke, Jeffrey Cox, and Donald Petcher, “Suboptimality and Complexity in Evolution, ” Complexity

67° Bhakti Niskama Shanta, “Life and consciousness - The Vedantic view, ” Communicative & Integrative Biology

68° (2015) Wolf-Ekkehard Lönnig, “Transposons in Eukaryotes (Part B): Genomic Consequences of Transposition, ”

69° Winston Ewert, W. A. Dembski and Robert J. Marks II, “Algorithmic Specified Complexity in the Game of Life, ” Systems, Man, and Cybernetics: Systems, IEEE Transactions, Vol. 45(4): 584-594 (April, 2015)

70° Laurence A Cole, “The Evolution of the Primate, Hominid and Human Brain, ” Journal of Primatology, Vol. 4(1), DOI:10.4172/2167-6801.1000124 (2015)

71°George D. Montañez, “Detecting Intelligence: The Turing Test and Other Design Detection Methodologies, ” 8th International Conference on Agents and Artificial Intelligence (ICAART 2016)

72° Dustin J. Van Hofwegen, Carolyn J. Hovde, and Scott A. Minnich, “Rapid Evolution of Citrate Utilization by Escherichia coli by Direct Selection Requires citT and dctA, ” Journal of Bacteriology, Vol. 198 (7): 1022-1034 (April, 2016).

73° Shanta, Bhakti Niskama, and Bhakti Vijnana Muni. "Why biology is beyond physical sciences?" (2016).

74° Lönnig, W.‐E. (2016). Carnivorous Plants. In eLS, John Wiley & Sons, Ltd (Ed.)

75° Dustin J. Van Hofwegen, Carolyn J. Hovde, and Scott A. Minnich, “Rapid Evolution of Citrate Utilization by Escherichia coli by Direct Selection Requires citT and dctA, ” Journal of Bacteriology

76° Wolf-Ekkehard Lönnig, “Mendel’s Paper on the Laws of Heredity (1866): Solving the Enigma of the Most Famous ‘Sleeping Beauty’ in Science, ” eLS (Jon Wiley & Sons, 2017)

77° Granville Sewell, “On ‘compensating’ entropy decreases, ” Physics Essays, Vol. 30:1 (2017).

78° Hössjer, Ola, Günter Bechly, and Ann Gauger. "Phase-Type Distribution Approximations of the Waiting Time Until Coordinated Mutations Get Fixed in a Population." International Conference on Stochastic Processes and Algebraic Structures. Springer, Cham, 2017.

79°Marks, Robert J., William A. Dembski, and Winston Ewert. Introduction to Evolutionary Informatics. 2017.

80°Basener, William F., and John C. Sanford. "The fundamental theorem of natural selection with mutations." Journal of mathematical biology 76.7 (2018): 1589-1622.

Sobre o meu artigo , ele criou um verdadeiro furacão na comunidade de biólogos brasileiros, recebi ameaças de processo da coordenação de geologia da UFG e a terceira autora que estava fazendo doutorado em evolução, mesmo estando grávida,  recebeu ameaças de perder a bolsa de doutorado caso não retirasse seu nome. O chefe editor informado do caso, que teve repercussão a ponto da revista retirá-lo,  me convidou para publicá-lo novamente  numa revista B1 . https://web.archive.org/web/20190119043352/https://academiapublishing.org/journals/ajsr/abstract/2017/Jul/Neto%20et%20al.htm

Neto, Sodré GB; AF, Everton; Sá, Mariana (2017). «Speciation in real time and historical-archaeological and its absence in geological time» [Especiação em Tempo Real, em Tempo histórico-Arqueológico, sua Ausência em Tempo Geológico com 71% de repetição Morfológica Fóssil]. Academia Journal of Scientific Research (em inglês). ISSN 2315-7712. doi:10.15413/ajsr.2017.0413. Consultado em 21 de maio de 2020

teste{{Citar periódico|ultimo=Neto|primeiro=Sodré GB|ultimo2=AF|primeiro2=Everton|ultimo3=Sá|primeiro3=Mariana|data=2017|titulo=Speciation in real time and historical-archaeological and its absence in geological time|titulotrad=Especiação em Tempo Real, em Tempo histórico-Arqueológico, sua Ausência em Tempo Geológico com 71% de repetição Morfológica Fóssil|url=https://www.academia.edu/39120976/Speciation_in_real_time_and_historical-archaeological_and_its_absence_in_geological_time|jornal=Academia Journal of Scientific Research|lingua=en|doi=10.15413/ajsr.2017.0413|issn=2315-7712|acessodata=21-05-2020}}

Sodré GB Neto - Primeiro autor do primeiro  artigo/tese científico publicado em revista internacional em defesa do criacionismo no Brasil (o artigo teve mais de 10.000 manifestações de professores de biologia principalmente darwinistas e ateus , os quais ameaçaram retirar a bolsa de doutorado em evolução da terceira autora, recebeu ameaças de processos, o DOI do mesmo foi cassado DOI:10.15413/ajsr.2017.0413 , e 485 revistas cientificas  listadas pela CAPES foram logo em seguida excluídas. O artigo contém um argumento simples ao defender que a repetição morfológica fóssil de 71% ,   fartamente admitida entre paleontólogos desde 1944 até hoje, proporção esta chamada de anomalia ou paradoxo da estase morfológica fóssil,  representa na verdade a amostragem  do sepultamento de todas as populações da terra e nunca representará  amostras intercaladas por drásticas mudanças ambientais (as quais mudam a morfologia de 99% dos seres vivos)  em supostos tempos de milhões e bilhões  de anos, por mais que milhares de artigos buscam em vão, cada um declarando o outro ser insuficiente, justificar tal "anomalia" por meio de ad hocs encabeçados pelas admissões honestas do pontualismo fóssil seguidas de justificativas falhas.

https://www.academia.edu/Documents/in/Catastrophic_Geomorphology

https://pt.quora.com/profile/Sodr%C3%A9-Neto-1

https://academiapublishing.org/journals/ajsr/abstract/2017/Jul/Neto%20et%20al.htm
DOI: 10.15413/ajsr.2017.0413

Resposta explicando o artigo
https://www.youtube.com/watch?v=i-WMw0kBDp8

***Até a substituição da PDF online, disponibilizamos gratuitamente o PDF em português ou inglês técnico revisado no link  . Academia Publishing possui corpo editorial com notas B3, B4 e C conforme lista da CAPES (Agencia governamental de apoio a pesquisadores)
https://www.facebook.com/groups/692838670925183/696896140519436/

Entrevista no Canal Inteligentista
https://www.youtube.com/watch?v=UmB42wwiyfk
Artigo de experiente cientista alemão repetindo mesma linha http://www.sensortime.com/loennig-dygmosoic-e.htm
Dynamic genomes, morphological stasis, and the origin of irreducible complexity

Participe do maior projeto de revolução de paradigmas enviando contribuição para a NOVA TEORIA NEOCATASTROFISTA DE IMPACTOS DE ASTEROIDES 
https://www.researchgate.net/project/IMPACT-NEOCASTROPHYSIS-THEORY/update/59951859b53d2ff30bda43c0

GEOLOGIAATUAL@GMAIL.COM

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3246854/

https://www.academia.edu/22511392/Quadro_1_-_Artigos_revisados_por_pares_que_d%C3%A3o_suporte_ao_design_inteligente?auto=download

Coffin, Harold G. 1971. Vertical flotation of Horsetails (Equisetum): geological implications. Geological Society of America Bulletin 82:2019-2022.

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• Stanley L. Jaki, “Teaching of Transcendence in Physics,” American Journal of Physics, Vol. 55(10):884-888 (October 1987).
• Granville Sewell, “Postscript,” in Analysis of a Finite Element Method: PDE/PROTRAN (New York: Springer Verlag, 1985).
• A.C. McIntosh, “Evidence of design in bird feathers and avian respiration,”International Journal of Design & Nature and Ecodynamics, Vol. 4(2):154–169 (2009).
• Richard v. Sternberg, “DNA Codes and Information: Formal Structures and Relational Causes,” Acta Biotheoretica, Vol. 56(3):205-232 (September, 2008).
• Wolf-Ekkehard Lönnig and Heinz Saedler, “Chromosome Rearrangement and Transposable Elements,” Annual Review of Genetics, Vol. 36:389–410 (2002).
• Douglas D. Axe, “Extreme Functional Sensitivity to Conservative Amino Acid Changes on Enzyme Exteriors,” Journal of Molecular Biology, Vol. 301:585-595 (2000).
• William A. Dembski, The Design Inference: Eliminating Chance through Small Probabilities (Cambridge: Cambridge University Press, 1998).

Again, for a more complete list of peer-reviewed pro-ID scientific publications, please download the full bibliography.

Coffin HG. 1983. Erect floating stumps in Spirit Lake, Washington. Geology 11:198-199.

Coffin HG. 1976. Orientation of trees in the Yellowstone Petrified Forests. Journal of Paleontology 50:539-543.

http://www.plosone.org/article/info%3Adoi/10.1371/journal.pone.0103436

NÃO EXISTE MAIS DESCULPA!
O DESIGN INTELIGENTE É "PEER-REVIWED"!

With respect to what this means for the theory of ID, go back and read Casey Luskin's post, "Intelligent Design Is Peer-Reviewed, but Is Peer-Review a Requirement of Good Science?" Casey concludes:

Despite the attempted lockout, ID proponents have published their ideas in peer-reviewed scientific journals. This shows that ID has academic legitimacy whether or not one applies the dubious "peer-review" test of good science.

That's right. Going forward, if you want to argue against ID, you are going to have to actually argue against it, critically analyze its arguments and its evidence, as opponents of ID so commonly refuse to do. There's no hiding behind claims of "peer review" anymore.

http://www.evolutionnews.org/2014/07/for_critics_of_087681.html

Em relação ao que isso significa para a teoria da identificação, volte e leia o post de Casey Luskin, "Design inteligente é Peer-Reviewed, mas é Peer-Review, uma exigência de boa ciência?" Casey conclui: apesar do tentativa de bloqueio, os proponentes ID publicaram suas idéias em revistas científicas. Isto mostra que a ID tem legitimidade acadêmica ou não aplica-se o teste de "peer-review" duvidosa de boa ciência.

Isso é direito. Daqui para frente, se você quer argumentar contra o ID, vais ter que realmente argumentar contra ele, analisar criticamente seus argumentos e suas provas, como opositores da ID tão comumente se recusam a fazer. Theres afirma que não é se esconder atrás de "peer review" mais.

http://www.evolutionnews.org/2014/07/for_critics_of_087681.html

Destaque Gerald Crabtree http://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(12)00158-8

Temos 8000 artigos - http://pt.wikipedia.org/wiki/Cria  e nestes muitas referencias a publicações. Muito material que precisa ser indicado, classificado como publicação em revistas seculares e de centros de pesquisa criacionistas.

Dr. Stephen Mayer, Michael Behe, William Dembski, Robert Marks e centenas de outros grandes nomes da ciência

http://www.discovery.org/a/2640

No Brasil,  destacamos o brilhante Dr. Marcos Nogueira Eberlin, que entre milhares de realizações de abrangencia mundial,  é o descobridor das reações de íons gasosos onde livros do mundo inteiro levam seu nome "reações de Eberlin". Lançou livro em defesa do DI, é criacionista bíblico.

http://www.fomosplanejados.com.br/capitulos/

4. Berthault, A sedimentação de uma mistura Heterogranular. Laminação Experimental em Still e água corrente, CR Acad. Sc., 1988, vol. 306, II Série, pp 717-724
5 Berthault, Sedimentologie:. Expériences sur la laminação des sédiments par granoclassement périodique postérieur au dépôt CR Acad.. Sc., 1986, vol. 303, par., 2, no. 17, pp 1569-1574.
6. Julien, Lan e Berthault, Experimentos em Estratificação de Heterogêneos areia Misturas, touro. Soe. Geol. France, 1993, vol. 164, n. 5, pp 649-660.
7. Berthault, Geológicas Princípios Dating Questionado, na revista Journal of Chinese Geodésia e Geodinâmica 22, No 3, 2002, pp 19-26
8. Berthault, Análise de princípios fundamentais da Statigraphy com base em dados experimentais, no Jornal russo Litologia e Recursos Minerais, tradução em Inglês de Litologiya i Polznye Iskopaemye 37, n ° 5, 2002, pp 509-515
9. Berthault, Interpretação sedimentológico do Grupo Estratigrafia Tonto (Grand Canyon do rio Colorado), litologia e Recursos Minerais 39, n ° 5, 2004, pp 504-508

LEITURA BÁSICA PARA CRIACIONISTAS E EVOLUCIONISTAS
http://www.trueorigin.org/camplist.asp

NOVIDADES EVOLUCIONISMO/CRIACIONISMO
https://www.facebook.com/groups/criacionismobiblicocientifico/?fref=ts

http://considereapossibilidade.wordpress.com/2012/10/01/mitocondrias-e-cloroplastos-simbiontes-evoluidos/

AQUI NESTE ARTIGO VEMOS QUE O INICIO DAS MUTAÇÕES DELETERIAS OCORREM RECENTEMENTE, ENTRE 5000 A 10 000 ANOS - Abstrato
Estabelecer a idade de cada segregação mutação em populações humanas contemporâneas é importante compreender plenamente a nossa história evolutiva, e ajudará a facilitar o desenvolvimento de novas abordagens para a descoberta de doenças gene. Estudos em larga escala de variação genética humana relataram assinaturas de recente crescimento populacional explosivo, notáveis por um excesso de variantes genéticas raras, sugerindo que muitas mutações surgiram recentemente. Para avaliar quantitativamente mais a distribuição das idades de mutação, nós resequenced 15.336 genes em 6.515 indivíduos de ascendência americano e Africano Europeu e inferir a idade de 1.146.401 autossômicas variantes de nucleotídeo único (SNVS). Nós estimamos que cerca de 73% de todos os SNVs codificadores de proteínas e cerca de 86% de SNVs previsto para ser deletério surgiu nos últimos anos 5.000-10.000. A idade média dos SNVs deletérios variou significativamente entre vias moleculares e genes de doenças continha uma proporção significativamente maior de SNVs deletérios recentemente surgiram de outros genes. Além disso, os americanos europeus tiveram um excesso de variantes deletérias em genes essenciais e mendeliana doença em comparação com os afro-americanos, de acordo com fraca seleção purificadora, devido à dispersão Out-of-Africa. Nossos resultados melhor delimitar os detalhes históricos de variação de codificação de proteína humana, mostram o efeito profundo da história humana recente sobre o ônus da SNVs deletérios segregando em populações contemporâneas e fornecer informações práticas importantes que podem ser usados para priorizar variantes na descoberta doença genética .http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?cmd=Search&term=Nature%5Bta%5D%20AND%20493%5Bvol%5D%20AND%20216%5Bpage%5D&doptcmdl=Abstract

Explosivo crescimento recente da população humana resultou em um excesso de variantes genéticas raras.
Keinan A , Clark AG .
Informações sobre o autor
Abstrato
As populações humanas têm experimentado um crescimento explosivo recente, uma expansão de pelo menos três ordens de magnitude ao longo dos últimos 400 gerações. Esta partida de equilíbrio distorce padrões de variação genética e distorce princípios básicos da genética populacional. Caracterizamos as assinaturas empíricas do crescimento explosivo no espectro de freqüência local e constatou que a discrepância em abundância variante rara entre os estudos de modelagem demográfica é principalmente devido a diferenças no tamanho da amostra. Recente crescimento rápido aumenta a carga de variantes raras e é susceptível de desempenhar um papel na carga genética individual do risco de doença complexa. Assim, o crescimento da população humana extrema recente tem de ser tomado em consideração no estudo da genética de doenças complexas e traços.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?cmd=Search&term=Science%5Bta%5D%20AND%20336%5Bvol%5D%20AND%20740%5Bpage%5D&doptcmdl=Abstract

Ciência 20 de novembro de 1998:
vol. 282 n. 5393 p. 1455
DOI: 10.1126/science.282.5393.1455
NOTÍCIA
ANTROPOLOGIA
Sem Última Palavra em Origens Idioma
Constance Holden
Os fósseis mostram que a capacidade do cérebro para a linguagem crua complexo, juntamente com a boca necessário e anatomia da garganta, provavelmente estavam no lugar antes de 150.000 anos atrás. Mas a maioria dos comportamentos que se pensa depender idioma - toolmaking, enterros, ea criação de locais de vida e arte e adorno pessoal - não apareceu até 40.000 anos atrás. Dentro deste intervalo de tempo cair dicas raros de comportamento moderno - enterros e vislumbres de comércio, arte e ferramentas sofisticadas - que permitiram que alguns arqueólogos para argumentar que os seres humanos estavam falando, e pensando os pensamentos complexos que vão com discurso, muito antes de deixou um registro abundante de tais atividades. Outros, porém, argumentam que não há nenhuma evidência inequívoca para o comportamento humano moderno antes de cerca de 50.000 anos atrás.http://www.sciencemag.org/content/282/5393/1455

RENSGA - Alguns arqueólogos acreditam que não há evidências convincentes de que pessoas conseguiram fazer tudo isso por 60 mil anos atrás, com base em namorar em dois locais de ferramentas de pedra no norte da Austrália. Mas neste, como em tantas outras dicas de comportamento moderno, o consenso é indescritível. A datação foi feita por termoluminescência, uma técnica que nem sempre se mostrou confiável. Gamble diz que a técnica mais confiável de datação por radiocarbono, embora capaz de voltar pelo menos 40.000 anos, nunca identificado um sítio arqueológico na Austrália mais velho do que 35.000.

Mesmo que as incertezas sobre artefatos e datas podem ser resolvidos, a questão de saber se linguagem totalmente moderna surgiu em uma etapa biológica ou cultural súbita há 40.000 anos ou gradualmente, ao longo dos últimos milhares de anos, não vai ser resolvido. "O problema fundamental aqui é que não há uma única espécie no planeta que tem a linguagem", diz o antropólogo da Universidade de Duke Matt Cartmill. "Temos um ponto de dados. Com tantas coisas únicas para os seres humanos, não sabemos o que a linguagem é necessário ou o que é necessário para a linguagem ".

E ainda haverá muito espaço para argumentar que a escassez de evidências de comportamento simbólico antes de 40 mil anos atrás não se provar que não estava acontecendo. Leslie Aiello, da University College London, por exemplo, diz que a prova poderia ter todos pereceram, afinal, ela observa, que seria muito difícil de pegar sinais de habilidades simbólicas a partir do registro arqueológico dos índios históricos da Califórnia, que tinham um complexo cultura, mas muito poucos artefatos produzidos em materiais duráveis como pedra.

Shea concorda, lembrando que um arqueólogo "é como o bêbado na velha piada que parece onde a luz é boa" para as chaves perdidas. Descobertas futuras podem alterar a história dos hominídeos: Embora existam mais de 100 locais escavados em sozinho sudoeste da França, Brooks observa, todos da África Oriental, o berço provável dos humanos modernos, tem apenas uma dúzia, e na Ásia, o registro é mais um grande ponto de interrogação. Assim paleoantropologia é um jogo para os filósofos, bem como cientistas, e não há muito espaço para o livre jogo da imaginação romântica. http://www.sciencemag.org/content/282/5393/1455.full

http://www.theguardian.com/culture/2014/jan/24/babylonian-tablet-noah-ark-constructed-british-museum

Estaremos aqui organizando para facilitar sua pesquisa alguns, contribua enviando sugestões!

BIOLOGIA

1. Siegfried Scherer "Basic Functional States in the Evolution of Light-driven Cyclic Electron Transport", Journal of Theoretical Biology ,104 [1983]: 289-299

2. Grant Lambert "Enzymic Editing Mechanisms and the Origin of Biological Information Transfer" Journal of Theoretical Biology, 107 [1984]:387- 403)

3. Wise, K. 2003. THE EVOLUTION OF CREATIONIST PERSPECTIVE ON THE FOSSIL EQUID SERIES. Geological Society of America Abstracts with Programs, Vol. 35, No. 6, p. 610 #

4. Stephen C. Meyer, "The Origin of Biological Information and the Higher Taxonomic Categories," Proceedings of the Biological Society of Washington, Vol. 117(2):213-239 (2004)*

5. Michael Behe and David W. Snoke, “Simulating evolution by gene duplication of protein features that require multiple amino acid residues,” Protein Science (2004), 13 *

6. Philip L. Skell, "Why do we invoke Darwin?," The Scientist, Vol. 19(16):10 (August 29, 2005)*

COSMOLOGIA

# Alexanian, M. 2002. Seven More Views on Intelligent Design. Physics Today (Letter). 55:10-11.

Frank J. Tipler, "A Brief History of the Extraterrestrial Intelligence Concept," Quarterly Journal of the Royal Astronomical Society, Vol. 22 (June 1981), pp. 133-145.*

# Chaffin, E. 2003. The Oklo Constraints on Alpha-Decay Half-Lives. American Physical Society, The 70th Annual Meeting of the Southeastern Section, November 6-8, Wilmington, North Carolina

# J.G. Hartnett, “Carmeli’s accelerating universe is spatially flat without dark matter”, Int. J. Theor. Phys., Vol. 44, no. 4, April, pp. 485-492, 2005.

# J.G. Hartnett, “The distance modulus determined from Carmeli's cosmology fits the accelerating universe data of the high-redshift type Ia supernovae without dark matter.” Found. Phys. vol 36. no. 6, pp. 839-861, June 2006. arxiv: astro-ph/0501526

# J.G. Hartnett, “Spiral galaxy rotation curves determined from Carmelian general relativity”, Int. J. Theor. Phys., vol. 45, no. 11, pp.2118-2136, November 2006. arxiv: astro-ph/0511756

# J.G. Hartnett, “The redshift-distance relation extended to higher redshifts in Cosmological General Relativity,” in the Proceedings of the 9th Symposium on the Frontiers of Fundamental Physics, Udine, Italy, AIP Conf. Proc. 1018, pp. 57-66, 2008.

GEOLOGIA

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JR Baumgardner, AA Snelling, DR Humphreys, and SA Austin. "The enigma of the ubiquity of 14 C in organic samples older than 100 ka". Eos Trans. AGU, 84(46), Fall Meet. Suppl., Abstract xxxxx-xx, 2003.

# Austin, S.A., A.A. Snelling and K.P. Wise, Canyon-length mass kill of orothocone nautiloids, Redwall Limestone (Mississippian) Grand Canyon, Arizona, Abstracts with Programs, Geological Society of America Annual Meeting, Denver, Colorado, p. A-421, 1999.

# Berthault, G., 1986. Sedimentology-experiments on lamination of sediments. C.R. Academie or Science (Paris), 303 (Series II, no. 17):1569-1574 (EN Tech. J., 3, 1988, pp. 25-29).

# Berthault, G., 1988. Sedimentation of a heterogranular mixture-experimental lamination in still and running water. C.R. Academie of Science (Paris), 306 (Series II):717-724 (EN Tech. J., 4, 1990, pp.95- 102).

# Berthault, G., 1986. Experiments on lamination of sediments, resulting from a periodic graded-bedding subsequent to deposition—a contribution to the explanation of lamination of various sediments and sedimentary rocks. Compte Rendus Académie des Sciences, Paris, 303 (Série II, no. 17):1569–1574.

# Brand, L.R. 1977. Coconino Sandstone (Permian) fossil vertebrate footprints — paleoecologic implications (abs.), American Association of Petroleum Geologists and Society of Economic Paleontologists and Mineralogists, Program and Abstracts, pp. 66-67, annual meeting, Washington, D.C.

# Brand, Leonard R. and Thu Tang, 1991. Fossil vertebrate footprints in the Coconino Sandstone (Permian) of northern Arizona: Evidence for underwater origin. Geology 19(12): 1201-1204.

1989: The Estimation of True Taxonomic Durations from Fossil
Occurrence Data, Ph.D. dissertation, Harvard University,
Cambridge, MA, 550 pp. Wise, Kurt P.

Wise teaches at Bryan College in Dayton, TN. Some articles by Wise that I'm
aware of (non-creationist publications):

1981: co-authored with Thomas J. M. Schopf: Was marine faunal
diversity in the Pleistocene affected by changes in sea
level?, Paleobiology, 7(3):394-399.

1991: The use of fossil occurrence data to distinguish between
instantaneous and stepwise extinction
[abstract], Geol. Soc. Am. Abstr. w/ Progr., 1991:A184.

1991: "The fossil record: The ultimate test-case for
young-earth creationism", Opus: A Journal for
Interdisciplinary Studies, 1991-92:17-29.

1995: with Steven A. Austin, "Nautiloid mass-kill event at a
hydrothermal mound within the Rewall Limestone
(Mississippian), Grand Canyon, Arizona" [abstract], Geol.
Soc. Am. Abstr. w/Progr., 27(6):A369.